MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 64128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011989	CTGT	2	8	149217	149224	0 %	50 %	25 %	25 %	222147143
2502	NC_011989	A	6	6	149233	149238	100 %	0 %	0 %	0 %	222147143
2503	NC_011989	GGA	2	6	149288	149293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147143
2504	NC_011989	GAC	2	6	149365	149370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147143
2505	NC_011989	CGG	3	9	149391	149399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147143
2506	NC_011989	ATC	2	6	149578	149583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147143
2507	NC_011989	TTG	2	6	149642	149647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147143
2508	NC_011989	ATC	2	6	149788	149793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147143
2509	NC_011989	TCG	2	6	149867	149872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147143
2510	NC_011989	CTG	2	6	149881	149886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147143
2511	NC_011989	TTGA	2	8	149896	149903	25 %	50 %	25 %	0 %	222147143
2512	NC_011989	GGC	3	9	150090	150098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147144
2513	NC_011989	GATC	2	8	150131	150138	25 %	25 %	25 %	25 %	222147144
2514	NC_011989	CCG	2	6	150143	150148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2515	NC_011989	CAT	2	6	150170	150175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147144
2516	NC_011989	CCG	2	6	150217	150222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2517	NC_011989	TCG	2	6	150232	150237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147144
2518	NC_011989	CAC	2	6	150242	150247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147144
2519	NC_011989	TCA	2	6	150286	150291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147144
2520	NC_011989	CGCCAT	2	12	150293	150304	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222147144
2521	NC_011989	CCG	2	6	150454	150459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2522	NC_011989	CGC	2	6	150533	150538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2523	NC_011989	CGC	2	6	150554	150559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2524	NC_011989	CAG	2	6	150570	150575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147144
2525	NC_011989	TCG	2	6	150577	150582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147144
2526	NC_011989	CCG	2	6	150583	150588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2527	NC_011989	CAT	2	6	150638	150643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147144
2528	NC_011989	TGA	2	6	150746	150751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147144
2529	NC_011989	GAT	2	6	150903	150908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147144
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2531	NC_011989	CGC	2	6	151025	151030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2532	NC_011989	CGC	3	9	151034	151042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2533	NC_011989	GCCACC	2	12	151212	151223	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222147144
2534	NC_011989	CAC	2	6	151244	151249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147144
2535	NC_011989	GTT	2	6	151269	151274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147144
2536	NC_011989	ATC	2	6	151306	151311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147144
2537	NC_011989	GTC	2	6	151408	151413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147144
2538	NC_011989	GCCCTC	2	12	151425	151436	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222147144
2539	NC_011989	GGA	2	6	151455	151460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147144
2540	NC_011989	ATC	2	6	151479	151484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147144
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2542	NC_011989	CCG	2	6	151591	151596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2543	NC_011989	TTCG	2	8	151632	151639	0 %	50 %	25 %	25 %	222147144
2544	NC_011989	CCA	2	6	151660	151665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147144
2545	NC_011989	CCGCC	2	10	151667	151676	0 %	0 %	20 %	80 %	222147144
2546	NC_011989	CGT	2	6	151748	151753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147144
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2552	NC_011989	GCC	2	6	151929	151934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2553	NC_011989	CAC	2	6	151955	151960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222147144
2554	NC_011989	CGC	2	6	151982	151987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2555	NC_011989	TCG	2	6	152008	152013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147144
2556	NC_011989	TGA	2	6	152045	152050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147144
2557	NC_011989	ATCGC	2	10	152122	152131	20 %	20 %	20 %	40 %	222147144
2558	NC_011989	CGC	2	6	152162	152167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2559	NC_011989	CGC	2	6	152270	152275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147144
2560	NC_011989	TCT	2	6	152323	152328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147144
2561	NC_011989	CAT	2	6	152339	152344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147144
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2563	NC_011989	AT	3	6	152470	152475	50 %	50 %	0 %	0 %	222147144
2564	NC_011989	ATG	2	6	152567	152572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147145
2565	NC_011989	GTC	2	6	152597	152602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147145
2566	NC_011989	ATC	2	6	152628	152633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147145
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2568	NC_011989	CGGT	2	8	152679	152686	0 %	25 %	50 %	25 %	222147145
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2578	NC_011989	CAGGG	2	10	153239	153248	20 %	0 %	60 %	20 %	222147145
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2591	NC_011989	CGA	2	6	153784	153789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147145
2592	NC_011989	CCGA	2	8	153795	153802	25 %	0 %	25 %	50 %	222147145
2593	NC_011989	CGG	3	9	153954	153962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147145
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2599	NC_011989	GCCA	2	8	154128	154135	25 %	0 %	25 %	50 %	222147145
2600	NC_011989	ATG	2	6	154171	154176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147145
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2604	NC_011989	GC	3	6	154806	154811	0 %	0 %	50 %	50 %	222147146
2605	NC_011989	CTG	2	6	154840	154845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147146
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2609	NC_011989	CAGT	2	8	155172	155179	25 %	25 %	25 %	25 %	222147147
2610	NC_011989	TGCT	2	8	155250	155257	0 %	50 %	25 %	25 %	222147147
2611	NC_011989	CG	3	6	155284	155289	0 %	0 %	50 %	50 %	222147147
2612	NC_011989	GC	3	6	155420	155425	0 %	0 %	50 %	50 %	222147147
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2615	NC_011989	CGC	2	6	155497	155502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147147
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2620	NC_011989	ACG	2	6	155829	155834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147147
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2737	NC_011989	CGA	2	6	161713	161718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147151
2738	NC_011989	TGG	2	6	161817	161822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147151
2739	NC_011989	GGCGAG	2	12	161837	161848	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	222147151
2740	NC_011989	TCA	2	6	162111	162116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147152
2741	NC_011989	CAAC	2	8	162126	162133	50 %	0 %	0 %	50 %	222147152
2742	NC_011989	AAG	2	6	162218	162223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147152
2743	NC_011989	TCG	2	6	162235	162240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147152
2744	NC_011989	CCG	2	6	162265	162270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147152
2745	NC_011989	CTT	2	6	162275	162280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147152
2746	NC_011989	GAA	3	9	162289	162297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147152
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2748	NC_011989	GCCG	3	12	162806	162817	0 %	0 %	50 %	50 %	222147153
2749	NC_011989	GTT	2	6	162887	162892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147153
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2753	NC_011989	GTC	2	6	163109	163114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147153
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2755	NC_011989	GC	3	6	163226	163231	0 %	0 %	50 %	50 %	222147153
2756	NC_011989	CGA	2	6	163273	163278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147153
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2760	NC_011989	GCCGAA	2	12	163517	163528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147153
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2768	NC_011989	TC	3	6	164206	164211	0 %	50 %	0 %	50 %	222147153
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2845	NC_011989	GA	3	6	168134	168139	50 %	0 %	50 %	0 %	222147156
2846	NC_011989	TTG	2	6	168159	168164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147156
2847	NC_011989	ACT	2	6	168195	168200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147156
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2849	NC_011989	TGG	2	6	168395	168400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147157
2850	NC_011989	CAGC	2	8	168468	168475	25 %	0 %	25 %	50 %	222147157
2851	NC_011989	GAA	2	6	168558	168563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147157
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2853	NC_011989	GCGGCA	2	12	168665	168676	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222147157
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2855	NC_011989	ATG	2	6	169069	169074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222147158
2856	NC_011989	GTCG	2	8	169109	169116	0 %	25 %	50 %	25 %	222147158
2857	NC_011989	TGT	2	6	169157	169162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222147158
2858	NC_011989	GAA	2	6	169204	169209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222147158
2859	NC_011989	GCC	2	6	169216	169221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147158
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2980	NC_011989	GCG	2	6	176457	176462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147165
2981	NC_011989	GAAC	2	8	176475	176482	50 %	0 %	25 %	25 %	222147165
2982	NC_011989	ATCT	2	8	176530	176537	25 %	50 %	0 %	25 %	222147165
2983	NC_011989	CCG	2	6	176676	176681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147165
2984	NC_011989	GGA	2	6	176913	176918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147165
2985	NC_011989	GTTC	2	8	176955	176962	0 %	50 %	25 %	25 %	222147165
2986	NC_011989	GATG	2	8	176994	177001	25 %	25 %	50 %	0 %	222147165
2987	NC_011989	GGCCT	2	10	177175	177184	0 %	20 %	40 %	40 %	222147165
2988	NC_011989	CAT	2	6	177189	177194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147165
2989	NC_011989	CGG	2	6	177263	177268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222147165
2990	NC_011989	GTG	3	9	177271	177279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147165
2991	NC_011989	AATA	2	8	177313	177320	75 %	25 %	0 %	0 %	222147165
2992	NC_011989	GGT	2	6	177354	177359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222147165
2993	NC_011989	GCC	2	6	177382	177387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147165
2994	NC_011989	CGC	2	6	177485	177490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222147166
2995	NC_011989	AGG	2	6	177568	177573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222147166
2996	NC_011989	TCA	2	6	177594	177599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222147166
2997	NC_011989	ACG	2	6	177678	177683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222147166
2998	NC_011989	GCGCTT	2	12	177725	177736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147166
2999	NC_011989	TTC	2	6	177788	177793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222147166
3000	NC_011989	TGC	2	6	177907	177912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222147166

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